🧬 Biyoinformatik Analiz Platformu
DNA ve protein dizilerini analiz edin, BLAST araması yapın, filogenetik ağaçlar oluşturun ve sekans hizalama gerçekleştirin. Modern biyoinformatik araçlarını keşfedin!
DNA/RNA Dizi Analizi
Dizi Girişi
BLAST Simülasyonu
Sorgu Dizisi
BLAST Nedir?
Basic Local Alignment Search Tool - dizilerin veritabanlarında benzerlik araması yapan algoritma. NCBI tarafından geliştirildi.
E-value
Expected value - rastgele bir eşleşmenin beklenen sayısı. Düşük E-value = daha anlamlı eşleşme. < 0.01 genellikle anlamlı.
Identity
Aynı pozisyonlardaki eşleşen baz/amino asit yüzdesi. Yüksek identity = yüksek benzerlik.
Sekans Hizalama
Dizileri Girin (FASTA formatı)
Filogenetik Ağaç Oluşturucu
Türler ve Diziler
Neighbor-Joining
En yaygın ağaç oluşturma yöntemi. Mesafe matrisine dayalı, hızlı ve etkili.
Dal Uzunlukları
Evrimsel mesafeyi temsil eder. Uzun dal = daha fazla mutasyon/zaman.
ORF (Açık Okuma Çerçevesi) Bulucu
DNA Dizisi
Başlangıç Kodonu
ATG (Metiyonin) - protein sentezinin başladığı kodon. Bakterilerde bazen GTG veya TTG de kullanılır.
Dur Kodonları
TAA (Ochre), TAG (Amber), TGA (Opal) - protein sentezinin durduğu kodonlar.
Okuma Çerçeveleri
Her DNA dizisinde 6 olası okuma çerçevesi vardır (3 forward, 3 reverse).